Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms