Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VIRMAQ69YN4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VIRMAQ69YN4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms