Protein–RNA interactions for Protein: Q68D10

SPTY2D1, Protein SPT2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTY2D1Q68D10 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTY2D1Q68D10 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTY2D1Q68D10 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTY2D1Q68D10 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTY2D1Q68D10 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTY2D1Q68D10 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTY2D1Q68D10 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTY2D1Q68D10 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTY2D1Q68D10 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTY2D1Q68D10 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTY2D1Q68D10 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTY2D1Q68D10 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTY2D1Q68D10 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTY2D1Q68D10 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTY2D1Q68D10 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTY2D1Q68D10 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTY2D1Q68D10 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTY2D1Q68D10 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTY2D1Q68D10 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTY2D1Q68D10 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTY2D1Q68D10 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTY2D1Q68D10 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTY2D1Q68D10 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTY2D1Q68D10 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms