Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG16L1Q676U5 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms