Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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TMEM78Q5T7P6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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TMEM78Q5T7P6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMEM78Q5T7P6 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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TMEM78Q5T7P6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM78Q5T7P6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM78Q5T7P6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM78Q5T7P6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM78Q5T7P6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM78Q5T7P6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM78Q5T7P6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM78Q5T7P6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM78Q5T7P6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM78Q5T7P6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM78Q5T7P6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM78Q5T7P6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM78Q5T7P6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM78Q5T7P6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM78Q5T7P6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM78Q5T7P6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM78Q5T7P6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM78Q5T7P6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM78Q5T7P6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM78Q5T7P6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM78Q5T7P6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM78Q5T7P6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM78Q5T7P6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM78Q5T7P6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM78Q5T7P6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM78Q5T7P6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM78Q5T7P6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMEM78Q5T7P6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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