Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFHC1Q5JVL4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms