Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FRMPD3Q5JV73 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FRMPD3Q5JV73 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FRMPD3Q5JV73 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD3Q5JV73 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD3Q5JV73 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD3Q5JV73 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD3Q5JV73 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD3Q5JV73 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD3Q5JV73 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD3Q5JV73 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD3Q5JV73 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD3Q5JV73 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD3Q5JV73 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD3Q5JV73 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD3Q5JV73 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD3Q5JV73 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD3Q5JV73 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD3Q5JV73 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD3Q5JV73 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD3Q5JV73 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD3Q5JV73 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD3Q5JV73 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD3Q5JV73 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD3Q5JV73 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD3Q5JV73 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD3Q5JV73 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD3Q5JV73 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms