Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms