Protein–RNA interactions for Protein: Q58FG1

HSP90AA4P, Putative heat shock protein HSP 90-alpha A4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AA4PQ58FG1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSP90AA4PQ58FG1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSP90AA4PQ58FG1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSP90AA4PQ58FG1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSP90AA4PQ58FG1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSP90AA4PQ58FG1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSP90AA4PQ58FG1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSP90AA4PQ58FG1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSP90AA4PQ58FG1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSP90AA4PQ58FG1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSP90AA4PQ58FG1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSP90AA4PQ58FG1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HSP90AA4PQ58FG1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSP90AA4PQ58FG1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSP90AA4PQ58FG1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSP90AA4PQ58FG1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HSP90AA4PQ58FG1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSP90AA4PQ58FG1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HSP90AA4PQ58FG1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSP90AA4PQ58FG1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HSP90AA4PQ58FG1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSP90AA4PQ58FG1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSP90AA4PQ58FG1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSP90AA4PQ58FG1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSP90AA4PQ58FG1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSP90AA4PQ58FG1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms