Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ANKRD39Q53RE8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms