Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PKDCCQ504Y2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PKDCCQ504Y2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PKDCCQ504Y2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PKDCCQ504Y2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PKDCCQ504Y2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PKDCCQ504Y2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
PKDCCQ504Y2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKDCCQ504Y2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms