Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0T1

Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SCART1, humanhuman

Predictions only

Length 1,027 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q4G0T1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q4G0T1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q4G0T1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q4G0T1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q4G0T1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q4G0T1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Q4G0T1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q4G0T1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q4G0T1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q4G0T1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q4G0T1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q4G0T1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q4G0T1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Q4G0T1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q4G0T1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q4G0T1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q4G0T1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q4G0T1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q4G0T1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q4G0T1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q4G0T1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q4G0T1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q4G0T1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q4G0T1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q4G0T1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q4G0T1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q4G0T1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q4G0T1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q4G0T1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q4G0T1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Q4G0T1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Q4G0T1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q4G0T1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q4G0T1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q4G0T1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q4G0T1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q4G0T1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q4G0T1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q4G0T1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q4G0T1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q4G0T1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q4G0T1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q4G0T1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q4G0T1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q4G0T1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q4G0T1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q4G0T1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q4G0T1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q4G0T1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q4G0T1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q4G0T1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q4G0T1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q4G0T1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Q4G0T1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q4G0T1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q4G0T1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q4G0T1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q4G0T1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q4G0T1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q4G0T1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q4G0T1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Q4G0T1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q4G0T1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q4G0T1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Q4G0T1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q4G0T1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q4G0T1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q4G0T1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q4G0T1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q4G0T1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q4G0T1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q4G0T1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q4G0T1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q4G0T1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q4G0T1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q4G0T1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q4G0T1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q4G0T1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q4G0T1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q4G0T1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q4G0T1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Q4G0T1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q4G0T1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q4G0T1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q4G0T1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q4G0T1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q4G0T1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q4G0T1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q4G0T1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q4G0T1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q4G0T1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q4G0T1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q4G0T1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q4G0T1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q4G0T1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q4G0T1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q4G0T1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q4G0T1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q4G0T1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q4G0T1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms