Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM1Q2NKQ1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SGSM1Q2NKQ1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms