Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTN1Q16799 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
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