Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA3Q16787 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA3Q16787 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA3Q16787 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA3Q16787 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA3Q16787 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA3Q16787 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LAMA3Q16787 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA3Q16787 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA3Q16787 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA3Q16787 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA3Q16787 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA3Q16787 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA3Q16787 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA3Q16787 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA3Q16787 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA3Q16787 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA3Q16787 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA3Q16787 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA3Q16787 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA3Q16787 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA3Q16787 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA3Q16787 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LAMA3Q16787 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA3Q16787 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA3Q16787 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA3Q16787 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA3Q16787 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA3Q16787 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA3Q16787 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA3Q16787 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA3Q16787 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA3Q16787 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA3Q16787 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA3Q16787 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA3Q16787 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA3Q16787 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LAMA3Q16787 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA3Q16787 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA3Q16787 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA3Q16787 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA3Q16787 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA3Q16787 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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