Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFE2Q16621 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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