Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ECM1Q16610 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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