Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SGCBQ16585 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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