Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDB1Q16531 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
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