Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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CNGA3Q16281 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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CNGA3Q16281 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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CNGA3Q16281 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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CNGA3Q16281 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNGA3Q16281 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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