Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ETFDHQ16134 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms