Protein–RNA interactions for Protein: Q15772

SPEG, Striated muscle preferentially expressed protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 3,267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEGQ15772 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPEGQ15772 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPEGQ15772 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms