Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF1AQ15573 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms