Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
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