Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCM1Q15154 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms