Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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GBX1Q14549 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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GBX1Q14549 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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GBX1Q14549 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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GBX1Q14549 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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GBX1Q14549 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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GBX1Q14549 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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GBX1Q14549 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
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GBX1Q14549 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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GBX1Q14549 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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GBX1Q14549 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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