Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RBM39Q14498 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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