Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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