Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNIQ14094 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCNIQ14094 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms