Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMC2Q13753 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMC2Q13753 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMC2Q13753 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMC2Q13753 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMC2Q13753 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
LAMC2Q13753 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LAMC2Q13753 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LAMC2Q13753 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LAMC2Q13753 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMC2Q13753 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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