Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
LAMB3Q13751 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms