Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH18Q13634 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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