Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEUROD1Q13562 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
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