Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDAC1Q13547 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
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