Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
BFSP2Q13515 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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