Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCIRG1Q13488 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
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