Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD4Q13485 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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