Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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