Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3FQ13275 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
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