Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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