Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM32Q13049 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM32Q13049 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms