Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
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