Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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