Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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FOXO1Q12778 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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FOXO1Q12778 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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FOXO1Q12778 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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FOXO1Q12778 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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FOXO1Q12778 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXO1Q12778 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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