Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBRQ0VD83 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms