Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNA1Q09470 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms