Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
POLEQ07864 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLEQ07864 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLEQ07864 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLEQ07864 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
POLEQ07864 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
POLEQ07864 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
POLEQ07864 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
POLEQ07864 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
POLEQ07864 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLEQ07864 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLEQ07864 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLEQ07864 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLEQ07864 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
POLEQ07864 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLEQ07864 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLEQ07864 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLEQ07864 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLEQ07864 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLEQ07864 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLEQ07864 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLEQ07864 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLEQ07864 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLEQ07864 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLEQ07864 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLEQ07864 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLEQ07864 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLEQ07864 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLEQ07864 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLEQ07864 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
POLEQ07864 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
POLEQ07864 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLEQ07864 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLEQ07864 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLEQ07864 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLEQ07864 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLEQ07864 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLEQ07864 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLEQ07864 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLEQ07864 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLEQ07864 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
POLEQ07864 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLEQ07864 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLEQ07864 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLEQ07864 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLEQ07864 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
POLEQ07864 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLEQ07864 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLEQ07864 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLEQ07864 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLEQ07864 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLEQ07864 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLEQ07864 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLEQ07864 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLEQ07864 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLEQ07864 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLEQ07864 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLEQ07864 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLEQ07864 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLEQ07864 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLEQ07864 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLEQ07864 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLEQ07864 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLEQ07864 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLEQ07864 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLEQ07864 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
POLEQ07864 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLEQ07864 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLEQ07864 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLEQ07864 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLEQ07864 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLEQ07864 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLEQ07864 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLEQ07864 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
POLEQ07864 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLEQ07864 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLEQ07864 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLEQ07864 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLEQ07864 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLEQ07864 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLEQ07864 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLEQ07864 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
POLEQ07864 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
POLEQ07864 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLEQ07864 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLEQ07864 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLEQ07864 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLEQ07864 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLEQ07864 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLEQ07864 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLEQ07864 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLEQ07864 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLEQ07864 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLEQ07864 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLEQ07864 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLEQ07864 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
POLEQ07864 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLEQ07864 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLEQ07864 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLEQ07864 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms