Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120 ms