Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms