Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN12Q05209 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms